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| 01.17 | 阪神大震災で阪神甲子園球場一部破損、自主トレーニングは各自となりキャンプは予定通り安芸で実施 |
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| 02.03 | （故）呉昌征、野球殿堂入り |
| 03.15 | 震災後初めて甲子園球場でオープン戦 |
| 07.23 | 中村勝広監督休養 |
| 07.23 | 藤田平ファーム監督、一軍監督代行に就任、野田征稔ファームディレクター、ファーム監督代行に就任 |
| 10.18 | 藤田平、監督に就任 |
| 11.13 | 仲田幸司、FA宣言（ロッテへ移籍） |
1996[H8] 監督：藤田平 柴田猛（代行） 成績：6位 54勝76敗0分
| 09.13 | 藤田平監督休養 柴田猛チーフ・コーチ、監督代行に就任 |
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| 09.29 | 2リーグ分裂後、通算3000勝利を達成（対巨人戦 5対1、投手 藪恵壹） |
| 10.09 | 公式戦最終戦（対中日戦、甲子園）、初回新庄剛志、塩谷和彦が史上初の1イニング2本の満塁本塁打を放ち完勝 |
| 10.25 | 吉田義男、監督に就任 |
| 11.03 | 和田豊、FA宣言（残留） |
1997[H9] 監督：吉田義男 成績：5位 62勝73敗1分
| 04.29 | 和田豊、開幕から21試合連続安打のプロ野球新記録を達成（4/5～5/3、24連続試合安打） |
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1998[H10] 監督：吉田義男 成績：6位 52勝83敗0分
| 05.26 | 川尻哲郎、対中日戦（倉敷）でノーヒットノーランゲームを記録（8人目） |
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| 10.12 | 坪井智哉、2リーグ制以降の新人最高打率を記録（打率.327） |
| 10.28 | 野村克也、監督就任、OB以外の監督は18年ぶり2人目、日本人監督としては球団初 |
| 11.06 | 八木裕、FA宣言（残留） |
| - | ウエスタン・リーグ12年ぶりの優勝（58勝35敗7分） |
| - | 坪井智哉、セ・リーグ新人選手特別賞（本塁打2本、打率.327） |
1999[H11] 監督：野村克也 成績：6位 55勝80敗0分
| 01.29 | 中西太、野球殿堂入り |
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| 10.01 | 大豊泰昭、26試合連続安打のチーム新記録を更新（8.24～） |
| 10.09 | ファーム選手権で日本ハムを7対3で下しファーム日本一になる |
| 11.05 | 伊藤敦規、FA宣言（残留） |
| 11.28 | FA宣言していたオリックスの星野伸之投手、入団表明 |
| - | ウエスタン・リーグ2年連続の優勝（59勝33敗8分） |
| - | ファーム日本選手権（沖縄）日本ハムを破り若手の日本一に輝く |
| - | 遠山奨志、カムバック賞 |
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